Quá trình xử lý nước thải sản xuất giấy được chia làm 2 giai đoạn chính:
+ Giai đoạn 1: Xử lý cơ học và hóa lý (nước thải sẽ được xử lý qua các bể: bể lắng cát, bể keo tụ tạo bông sau đó lắng hóa lý. Mục đích của quá quá trình này là làm giảm các chất lơ lửng và giảm nồng độ các chất ô nhiễm SS, BOD, COD có trong nước thải trước khi chuyển qua xử lý sinh học).
+ Giai đoạn 2: Xử lý sinh học: quá trình này diễn ra trong bể sinh học hiếu khí (Bể arotank). Bể Aerotank có nhiệm vụ xử lý các chất hữu cơ còn lại trong nước thải. Tại đây diễn ra quá trình oxi hóa các chất hữu cơ hòa tan và dạng keo trong nước thải dưới sự tham gia của vi sinh vật hiếu khí.
Trong bể Aerotank có hệ thống sục khí dưới đáy bể bằng hệ thống cấp khí nhằm cung cấp oxi, tạo điều kiện thuận lợi cho vi sinh vật hiếu khí sống, phát triển và phân giải các chất ô nhiễm.