Giải trình tự Metagenomics ứng dụng kỹ thuật giải trình tự gene thế hệ mới nhằm nghiên cứu tập hợp bộ gene của các sinh vật trong mẫu. Phương pháp có ưu điểm là một công cụ hiện đại, hiệu quả cao, có phân tích, phân loài và chức năng của các loài vi sinh trong những loại mẫu môi trường mà không cần bước nuôi cấy. Giải trình tự Metagenomics có thể ứng dụng trong nhiều lĩnh vực như: Xử lý môi trường;Trồng trọt; Chăn nuôi; Thủy hải sản; Sản xuất thực phẩm; Y dược.
Hiện nay giải trình tự gen được ứng dụng khá phổ biến ở tất cả các lĩnh vực, trong đó giải trình tự Metagenomics ứng dụng kỹ thuật giải trình tự gene thế hệ mới nhằm nghiên cứu tập hợp bộ gene của các sinh vật trong mẫu. Phương pháp bao gồm: Metabarcoding xác định thành phần vi sinh; Shotgun metagenomics cho phép xác định thành phần các gene chức năng và con đường biến dưỡng của hệ vi sinh trong mẫu. Phương pháp có ưu điểm là một công cụ hiện đại, hiệu quả cao, có phân tích, phân loài và chức năng của các loài vi sinh trong những loại mẫu môi trường mà không cần bước nuôi cấy.
Ở phương pháp giải trình tự Metagenomics, Công ty KTest có 2 cách tiếp cận khác. Cách thứ nhất 16S Metabarcoding (cây phả hệ dựa trên rRNA) giúp xác định thành phần quần xã vi sinh vật dựa trên giải trình tự vùng gene chỉ thị như 16S rRNA (vi khuẩn), ITS (nấm),… nhằm tiết kiệm chi phí và nhanh chóng hiểu được cấu trúc của một cộng đồng vi sinh. Tuy nhiên, khả năng phân loại đến mức loài và hiểu về chức năng còn giới hạn và chỉ nhận diện nhóm vi sinh vật mục tiêu.
Ở cách tiếp cận thứ hai, thay vì chỉ giải trình tự gene chỉ thị, Shotgun Metagenomics giải trình tự toàn bộ vật liệu truyền trong mẫu môi trường. Điều này không chỉ cho phép xác định thành phần, tỷ lệ vi sinh vật hiện diện trong mẫu mà còn cung cấp thông tin chú giải thành phần các gene chức năng. Cách tiếp cận thứ hai này cần lượng dữ liệu và chi phí cao hơn cách tiếp cận thứ nhất.
Phương pháp giải trình tự Metagenomics có thể ứng dụng trong nhiều lĩnh vực như:
• Xử lý môi trường: Phân tích, theo dõi hệ vi sinh trong môi trường trước và sau xử lý theo thời gian; tìm hiểu hệ vi sinh trong những khu vực ô nhiễm; phân tích thành phần vi sinh trong các chế phẩm sinh học dùng để xứ lý môi trường;...
• Trồng trọt: Phân tích, theo dõi thành phần vi sinh có lợi/ có hại trong đất trồng; hệ vi sinh cộng sinh với rễ cây; so sánh hệ vi sinh của các loại đất trồng khác nhau;…
• Chăn nuôi: Phân tích hệ vi sinh trong cơ thể động vật mắc bệnh để xác định tác nhân gây bệnh; đánh giá tác động của probiotics lên hệ vi sinh trong vật nuôi;...
• Thủy hải sản: Phân tích, theo dõi thành phần vi sinh có lợi/ có hại trong môi trường nuôi tôm/cá; đánh giá tác động của probiotics lên hệ vi sinh trong thủy sản;…
• Sản xuất thực phẩm: Phân tích, so sánh thành phần vi sinh trong các sản phẩm lên men, phương pháp lên men,...
• Y dược: Phân tích hệ vi sinh trong mẫu phân (hệ tiêu hóa) hoặc da người,…
Thông qua hội thảo, Ktest mong muốn được hợp tác với các đơn vị có nhu cầu.
Nhằm thúc đẩy sự hợp tác nghiên cứu, ứng dụng, phát triển sản phẩm, dịch vụ của các doanh nghiệp, Trung tâm Thông tin và Thống kê Khoa học và Công nghệ TP. HCM phối hợp với Công ty TNHH Khoa học KTest tổ chức hội thảo giới thiệu: “Giải trình tự Metagenomics - Phân tích hệ vi sinh môi trường”.
Thời gian hội thảo: Từ 8h30-11h00, Thứ tư, 19/10/2022.
Hình thức: Trực tiếp kết hợp trực tuyến
• Trực tiếp: Tại Sàn Giao dịch Công nghệ TP. HCM - Techmart Daily số 79 Trương Định, P. Bến Thành, Q.1, TP.HCM
• Trực tuyến: Trên nền tảng ứng dụng Google Meet
Bên cạnh đó, Quý đơn vị có thể xem livestream sự kiện và đặt câu hỏi cho chuyên gia bằng cách truy cập vào chuyên mục Thảo luận công nghệ trên trang Techport.vn hoặc trang Fanpage CESTI (www.facebook.com/CESTI.VN). Vui lòng đăng ký trước ngày 19/10/2022 tại đây để nhận đường link tham dự và tài liệu hội thảo.
Mọi thông tin vui lòng liên hệ:
Trung tâm Thông tin và Thống kê Khoa học và Công nghệ TP. HCM
Phòng Giao dịch Công nghệ
79 Trương Định, phường Bến Thành, Quận 1, TP. HCM
ĐT: (028) 3521 0735 - Fax: (028) 3829 1957
DĐ: 0939 413 733 (gặp Thùy Vân)
Email: giaodichcongnghe@cesti.gov.vn
Trung tâm trân trọng kính mời./.
Techport.vn