Chức năng, nhiệm vụ theo quy định của cơ quan chủ quản:
Căn cứ Quyết định số 161/2004/QĐ-UBND ngày 02/7/2004 của Ủy ban nhân dân TP. Hồ Chí Minh, Trung tâm Công nghệ sinh học có các chức năng, nhiệm vụ như sau:
- Nghiên cứu, ứng dụng, chuyển giao công nghệ sinh học phục vụ trong lĩnh vực nông nghiệp, xử lý môi trường, công nghiệp thực phẩm và y dược học;
- Tiếp nhận, triển khai các quy trình, kỹ thuật hiện đại về công nghệ sinh học (công nghệ gene, công nghệ tế bào động thực vật, công nghệ vi sinh, công nghệ lên men...) phục vụ sản xuất, bảo quản, chế biến các sản phẩm nông nghiệp và xử lý môi trường;
- Đào tạo, huấn luyện các kỹ thuật viên về công nghệ sinh học;
- Sản xuất, thương mại hóa các sản phẩm công nghệ sinh học.
Chức năng, nhiệm vụ theo Giấy chứng nhận hoạt động khoa học công nghệ:
Trung tâm Công nghệ Sinh học TP. Hồ Chí Minh được Sở Khoa học và Công nghệ TP. Hồ Chí Minh cấp Giấy chứng nhận hoạt động khoa học công nghệ số 175/ĐK-KHCN ngày 02/8/2007, với các lĩnh vực hoạt động như sau:
- Nghiên cứu cơ bản và ứng dụng trong công nghệ sinh học, nông nghiệp, y dược và môi trường;
- Sản xuất thử nghiệm, chuyển giao công nghệ, triển khai các quy trình kỹ thuật hiện đại về công nghệ sinh học phục vụ sản xuất, bảo quản, chế biến các sản phẩm nông nghiệp, y tế và môi trường;
- Dịch vụ khoa học và công nghệ: Tư vấn kỹ thuật, tổ chức huấn luyện, bồi dưỡng thực nghiệm, chuyển giao công nghệ, phổ cập kiến thức công nghệ sinh học;
- Hợp tác trong và ngoài nước theo lĩnh vực đăng ký.