Theo quyết định thành lập, Viện Cơ học và Tin học ứng dụng là một đơn vị Nghiên cứu khoa học công nghệ có nhiệm vụ sau:
Nghiên cứu những vấn đề khoa học cơ bản làm cơ sở cho việc phát triển các hướng công nghệ mới và ứng dụng trong lĩnh vực: cơ học biển, dầu khí, máy móc, công trình, vật liệu xây dựng, chế tạo máy, tự động hóa - rô bốt.
Nghiên cứu ứng dụng và chuyển giao công nghệ mới trong lĩnh vực cơ học và tin học phục vụ quản lý và xử lý môi trường nước, đất, không khí.
Nghiên cứu, khảo sát, xác định các chỉ tiêu cơ - lý của đất, đá, vật liệu, các điều kiện địa cơ học phục vụ thiết kế thi công các công trình xây dựng.
Triển khai các kết quả nghiên cứu và ứng dụng các công nghệ mới để thiết kế, chế tạo thiết bị phục vụ các ngành công nghiệp dược, y tế, thực phẩm, hàng tiêu dùng, xây dựng, công nghệ môi trường và các ngành công nghiệp khác
Nghiên cứu những vấn đề cơ bản của công nghệ thông tin và khoa học tính toán
Ứng dụng và triển khai công nghệ thông tin trong các lĩnh vực kinh tế, xã hội, khoa học, kỹ thuật.
Sản xuất thử nghiệm trong lĩnh vực cơ học và tin học ứng dụng.
Thực hiện các dịch vụ khoa học, công nghệ trong lĩnh vực cơ học và tin học (đo đạc, kiểm định, hiệu chỉnh, tư vấn, thông tin, hội thảo khoa học, ...)
Tham gia với các ngành, địa phương trong việc xét duyệt luận chứng kinh tế kỹ thuật và chuyển giao công nghệ trong lĩnh vực cơ học và tin học.
Tham gia đào tạo các cán bộ khoa học có trình độ cao trong lĩnh vực cơ học và tin học.
Thực hiện hợp tác quốc tế trong NCKH , đào tạo và phát triển công nghệ về cơ học và tin học ứng dụng.